Di dalam masjid yang dibangun tahun 1154 Masehi inilah terdapat makam cucu Rasulullah SAW, Hussein bin Ali bin Abi Thalib. Berada di sekitar kompleks Kairo lama, berhadapan dengan masjid Al-Azhar dan hanya beberapa meter dari Azhar Park.

Riwayat mengisahkan, makam ini hanya berisi kepala Sayyidina Hussein, sementara jasadnya dimakamkan di padang Karbala, tempat di mana Sayyidina Hussein gugur pada pertempuran Karbala, Irak.

Pertempuran antara Sayyidina Hussein dengan sekitar 70 pasukannya berhadapan dengan Ubaidullah bin Ziyad masa khalifah Yazid bin Muawiyyah dari Bani Umayyah dengan ribuan pasukannya karena ketidaksepahaman terhadap siapa yang akan meneruskan kekhalifahan.

Makam Sayyidina Hussein berada tepat di belakang mimbar masjid. Berbentuk persegi empat berwarna keperakan berhiaskan ayat suci Al Quran dan bertuliskan nasab beliau dengan banyak bunga. Pagar setinggi dada orang dewasa mengelilingi makam.

Berziarah ke masjid ini pada hari Jumat, masjid penuh dengan peziarah yang terdiri dari warga Mesir dan wisatawan Mancanegara. Selepas sholat jumat, banyak peziarah mendatangi makam Sayyidina Hussein sekadar memanjatkan doa untuknya dan membaca Al Quran di sekitaran Masjid. Banyak juga peziarah yang mengabadikan momen berziarahnya di ponsel pribadi.